Казахский научно-исследовательский институт онкологии и радиологии был организован приказом Министерства здравоохранения от 5 июля 1960 года на основании Постановления Совмина Казахской ССР.
Первым директором был назначен заслуженный врач республики Сакен Нугманович Нугманов.