Моделирование ионных каналов — 2-я лекция курса «Новости компьютерного моделирования биосистем»

Недаром в заставке этой лекции я использовал изображение скульптуры калиевого канала, носящей название «Рождение идеи». Весь наш сложный внутренний мир, включая когнитивные процессы и драгоценные переживания, в конечном итоге сводится к таким «простым» вещам как работа ионных каналов в мембранах нервных клеток. Почему слово «простые» я тут поставил в кавычки? Да потому что на самом деле это довольно сложно! Слушаем и просвещаемся — как в наше время моделируют работу ионных каналов на компьютере. Статьи, упомянутые в лекции: 1. Principles of conduction and hydrophobic gating in K channels () 2. Mechanism of Voltage Gating in Potassium Channels () 3. Insights into the function of ion channels by computational electrophysiology simulations () 4. Conductance selectivity of Na across the K channel via Na trapped in a tortuous trajectory () 5. Gating and modulation of an inward-rectifier potassium channel () 6. 12 методов в картинках: нейробиология () 7. Калиевый канал in silico () 8. Первая лекция цикла: Оглавление: 0:00 Введение 06:29 Общие понятия об ионных каналах 51:48 1. Моделирование калиевого тока через Kv 1:05:23 2. Модель активации (открывания/закрывания) Kv 1:24:58 3. Компьютерная электрофизиология (CompEl) 1:30:23 4. Вопросы селективности Kv 1:37:12 5. Калиевый канал «входящего выпрямления» (Kir)