Часть 2. Аллель-специфичное связывание факторов транскрипции. И. Кулаковский.

Экспрессия генов на уровне транскрипции у высших эукариот регулируется факторами транскрипции, специфически связывающими характерные участки ДНК в регуляторных районах генов — промоторах и энхансерах. Сила связывания факторов транскрипции и экспрессия генов под их контролем часто зависит от индивидуальных геномных вариантов соответствующих регуляторных последовательностей. Во многих случаях такие варианты связаны с риском возникновения или тяжелого течения различных заболеваний, в том числе аутоиммунных и онкологических. Аллель-специфичное (т.е. зависимое от аллеля) связывание факторов транскрипции предоставляет естественный источник информации о регуляторных вариантах генома. Во второй части () будет представлена наиболее полная на сегодня карта аллель-специфичного связывания факторов транскрипции человека (), построенная путем метаанализа результатов нескольких тысяч экспериментов по иммунопреципитации хроматина с последующим глубоким секвенированием (ChIP-Seq