Созданная нейросетью система CRISPR-Cas9 отредактировала геном человеческих клетокАмериканские исследователи представили первы

Созданная нейросетью система CRISPR-Cas9 отредактировала геном человеческих клеток Американские исследователи представили первый нейросетевой инструмент для создания полностью искусственных систем редактирования генома CRISPR-Cas9. Одну из них успешно испытали на человеческих клетках. Ученые провели систематический сбор данных из 26,2 трлн пар оснований микробных геномов и метагеномов из разных родов и биомов. После этого языковую модель на основе ProGen2 настроили на работу с CRISPR-Cas Atlas и с ее помощью сгенерировали 4 млн последовательностей, сбалансированных по семействам белков и размеру кластеров (на это ушло три дня с использованием 16 графических процессоров). Их распределили по типам CRISPR-Cas и отсеяли заведомо нефункциональные варианты. Наилучший из них — PF-CAS-182. Его последовательность совпадала с SpCas9 почти на 72%. Этот белок назвали OpenCRISPR-1 и выложили его последовательность в открытый доступ. Более того, OpenCRISPR-1 совместили со сгенерированными языковой моделью адениндеаминазами и получили функциональную систему редактирования азотистых оснований, эффективно заменяющую аденин на гуанин в заданных участках ДНК. Все прошло успешно. Смотреть в источнике ()